Reyes Romero, Milagro Dolores (2023) Análisis de variabilidad genética mediante marcadores universales en cultivos de Indigofera suffruticosa (Fabaceae) en El Salvador. Bachelor thesis, Universidad de El Salvador.

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Abstract

Esta investigación representa un primer acercamiento al estado genético de la planta Indigofera suffruticosa, que además de ser nativa, ha sido usada en épocas precolombinas y postcolombinas para la producción del colorante natural añil y fuente importante en la economía salvadoreña. Siendo el objetivo principal analizar la variabilidad genética de dicha planta en estado de cultivo. Para la realización de dichos análisis se tomaron muestras de tejido foliar de cinco cultivos, distribuidos en el territorio salvadoreño en los Departamentos de: Santa Ana, La Libertad, Cuscatlán, Usulután y San Miguel que representa un grupo control, los muestreos se realizaron en función de la época de cosecha en los diferentes sitios entre los meses de julio, agosto, septiembre y octubre. Las muestras recolectadas fueron debidamente lavadas y desecadas, luego se pulverizaron y guardaron bajo refrigeración, posteriormente se les aplicó un protocolo de extracción de ADN a cada muestra registrada, recopilando un total de 49 muestras de ADN óptimas usadas en PCR para la amplificación del fragmento ITS2 que consta básicamente de 400 pb, mismos productos que fueron evaluados mediante electroforesis para realizar la respectiva secuenciación y análisis bioinformáticos. El análisis de las poblaciones estudiadas de I. suffruticosa de los diferentes sitios de muestreo reveló mediante el método UPGMA (Unweighted Pair Group Method using Arithmetic) una historia evolutiva en la que se diferencian dos grupos de nucleótidos de 31 y 16 respectivamente; una diversidad genética baja con dos haplotipos, una diversidad haplotípica de 0.46 y diversidad nucleotídica del 0.0044, siendo el Cantón San Francisco en Usulután el que aportó mayores valores de diversidad genética que el resto de las poblaciones en los índices antes mencionados. Se identifica una diversidad genética entre poblaciones predominantemente baja; por ejemplo, en el coeficiente de diferenciación genética (FST) en sus conjugaciones de poblaciones (CB/HNA, CB/JB, HNA/JB, con valores de 0.0; CB/CSF, CSF/HNA, CSF/JB con valores de 0.4); siendo que, en diez conjugaciones de poblaciones, únicamente tres de ellas (CB/CPB, CPB/HNA, CPB/JB, con valores de 1.0) muestran una notoria diferenciación muy significativa. Se edificó una red de haplotipos en la que se distinguen claramente dos haplotipos, concluyendo que este tipo de sistema de cultivo está altamente influenciado por la selección artificial y altos procesos endogámicos.

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